"...сетевой фильтр, где в качестве фильтрующего элемента только дисковый конденсатор, параллельно входу" - это вовсе не конденсатор, а варистор.
Сабж никоим образом не фильтрует помехи по сети, а за счет варистора защищает нагрузку от бросков напряжения (там еще должен быть автоматический размыкатель, срабатывающий при перегрузках по току).
Поэтому, любая модификация его, назначенная резать помехи по сети, улучшит его качество в 100500 раз

.
Так что, если вставить в него фильтр, то получится однозначно не хуже.
Фильтрация помех по сети имеет, как минимум, одно очень полезное свойство: зная, что аппаратура питается фильтрованным напряжением, владелец оной спит гораздо крепче.
Так что - ставь внутрь фильтр без сомнений.