Вообще, насколько я помню, выпускались специальные автоматизированные (и компьютеризированные) устройства для тестирования и тренировки аккумуляторов (типа Cadex и т.п). Мы же в своей конторе прекрасно обходились самодельным: электронная нагрузка с фиксированным током нагрузки, отключаемая компаратором напряжения и соединённая с китайским будильником в качестве таймера, питаемого от схемы в режиме активности. Подключаем полностью заряженный аккумулятор, обнуляем таймер, нажимаем кнопочку (стартуем принудительный разряд) и оставляем в покое. Через пару часов (после погасания индикатора активности) смотрим, сколько времени таймер отработал до остановки схемы при достижения разрешённого фиксированного порога разряда. Зная стабильный ток разряда, имеем из времени наработки интересующие нас реальные миллиампер-часы.
Для справки, вот пороги работы аккумуляторов (для одиночного элемента!):
NiCd(NiMh) 1,35/1,15 = полный/пустой
LiIon(LiPol) 4,15/3,30 = полный/пустой