Если по-разному дёргать струны - фаза тоже будет разная. Считаю, что для гитары абсолютно не имеет смысла следить за чётным количеством переворота фазы в усилительных каскадах. Тогда придётся ещё задуматься о сдвигах фазы на всех реактивных элементах в диапазоне нескольких октав.
Для примера есть вот такая история: работали мы с другом как-то раз в день города на джазовой сцене. У нас был весь живой бэклайн и крутая игрушка - цифровой пульт ямаха, не помню какой модели. (Игрушка просто обалденная - какие хочешь фильтры, компрессоры, эффекты, и всё-всё-всё! Очень интересный опыт был погонять высокодобротный фильтр по всему диапазону.) В процессе выступлений я заметил, что от удара бочки динамики на субах прыгают внутрь. "Непорядок" - подумал я, и попросил друга, стоящего за пультом, перевернуть фазу сигнала с бочечного микрофона. Диффузоры стали прыгать наружу, но ощутимой разницы не было абсолютно никакой. И это - бочка. А вы про гитару волнуетесь. 8-)